一、转换角色，把自己当作可能的攻击者
大部分时候，我们若只是站在WEB管理员的角度上考虑问题，可能就发现不了Web服务器的漏洞。相反，我们此时若能够换个角度，把自己当作可能的攻击者，从他们的角色出发，想想他们可能会利用那些手段、哪些Web服务器的漏洞进行攻击，或许，我们就可以发现Web服务器可能存在的安全漏洞，从而早先一步，修补安全漏洞，防止被木马或者病毒攻击。
从公司外面访问自己的Web服务器，进行完正的检测，然后模拟攻击自己的网站，看看，会有什么样的结果。这对于WEB的安全性来说，可能是一种很好的方法。如我们可以假当攻击者，利用扫描工具，对Web服务器进行扫描，看看有否存在可以被攻击的服务。有些东西我们平时可能不会引起我们重视，但是，利用黑客常用的工具进行扫描，就会发现一些可能会被他们利用的服务或者漏洞。如在服务器安装的时候，操作系统会默认的安装并启动一些不需要的服务;或者在服务器配置的时候，需要启动一些服务，但是事后没有及时的关闭，从而给了不法攻击者一个攻击的机会。最常见的如SNMP服务，又称简单网络管理协议。这个服务在系统安装完毕后，默认情况下是开启的。但是，这个服务可以为攻击者提供服务器系统的详细信息，如Web服务器是采用了什么操作系统，在服务器上开启了什么服务与对应的端口等等宝贵的信息。攻击者只有了解这些最基本的信息之后，才能够开展攻击。
我们安全管理人员，在平时的时候可能不会发现这个问题，但是，若能够利用黑客的扫描工具一扫描，就能够发现问题的所在。故在必要的时候，需要换个角度，从攻击的角色出发，考虑他们会采用什么样的攻击方法。如此的话，我们才可以避免“当局者迷”的错误，保障Web服务器的安全。
二、合理的权限管理
有时候，在一台服务器上，不仅运行了Web服务器，而且还会运行其他的诸如FTP服务器之类的网络服务。在同一台服务器上应用多种网络服务的话，很可能造成服务之间的相互感染。也就是说，攻击者只要攻击一种服务，就可以利用相关的技术，攻陷另一种应用。因为攻击者之需要攻破其中一种服务，就可以利用这个服务平台，从企业内部攻击其他服务。而一般来说，从企业内容进行攻击，要比企业外部进行攻击方便的多。
那或许有人会说，那不同服务采用不同服务器就可以了。其实，这对于企业来说，可能是种浪费。因为从性能上讲，现在的服务器上同时部署WEB服务与FTP服务的话，是完全可行的，性能不会受到影响。为此，企业从成本考虑，会采取一个服务器。而现在给我们安全管理员出了一个难题，就是在两种、甚至两种以上的服务同时部署在一台服务器上，如何保障他们的安全，防止他们彼此相互之间感染呢?
例如现在的Web服务器上运行着三种服务。一个是传统等WEB服务;二是FTP服务;三是OA(办公自动化)服务，因为该服务是WEB模式的，互联网上也可以直接访问OA服务器，所以也就把他部署在这台服务器上。由于这台服务器的配置还是比较高的，所以，运行这三个服务来说，没有多少的困难，性能不会有所影响。现在的问题是，如号来保障他们的安全，FTP服务器、OA服务器与Web服务器之间安全上不会相互影响呢?
现在采用的是Windows2003服务器，为了实现这个安全需求，把服务器中所有的硬盘都转换为NTFS分区。一般来说，NTFS分区比FAT分区安全性要高的多。利用NTFS分区自带的功能，合理为他们分配相关的权限。如为这个三个服务器配置不同的管理员帐户，而不同的帐户又只能对特定的分区与目录进行访问。如此的话，即使某个管理员帐户泄露，则他们也只能够访问某个服务的存储空间，而不能访问其他服务的。如把WEB服务装载分区D，而把FTP服务放在分区E。若FTP的帐户泄露，被攻击利用;但是，因为FTP帐户没有对分区D具有读写的权利，所以，其不会对Web服务器上的内容进行任何的读写操作。这就可以保障，其即时攻陷FTP服务器后，也不会对Web服务器产生不良的影响。
虽然说微软的操作系统价格昂贵，而安全漏洞又比较多，但是，其NTFS分区上的成就表现还是不差的。在NTFS分区上，可以实现很大程度的安全管理，保障相关服务于数据的安全性。所以最后还是采用了微软的2003操作系统作为服务器系统，而没有采用Linux系统。
三、脚本安全管理
根据以往经验，其实很多Web服务器因为被攻击而瘫痪，都是由于不良的脚本所造成的。特别是，